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Die Fakultät für Informatik und Elektrotechnik wurde am 1. Januar 2004 gegründet und vertritt die Fachgebiete Elektrotechnik, Informatik und Wirtschaftsinformatik. Diese Fachgebiete waren zuvor anderen Struktureinheiten zugeordnet bzw. sind aus diesen hervorgegangen. Die Elektrotechnik gibt es in Rostock eigenständig seit 1953. Sie entstand kurz nach der Gründung der ersten Ingenieurwissenschaftlichen Fakultät an einer allgemeinen Universität in Deutschland im Jahre 1950. Im Bereich der Wirtschaftswissenschaften entstand die Wirtschaftsinformatik, die seit 1966 ein eigenständiges Fachgebiet ist. Im Bereich der Mathematik und des Universitätsrechenzentrums entwickelte sich die Informatik, die seit 1969 als eigenständiges Fachgebiet in Rostock existiert.